More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1218 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  417  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  29.15 
 
 		 213 aa  89.7  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34.38 
 
 		 251 aa  75.5  0.0000000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 195 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 241 aa  73.2  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 233 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 242 aa  72  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  26.6 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 202 aa  70.5  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  26.7 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  26.11 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 195 aa  68.6  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  21.67 
 
 		 214 aa  65.5  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 226 aa  64.7  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  38.96 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  25.12 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 256 aa  63.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 260 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 237 aa  63.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5607  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.897418  normal  0.557491 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 291 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 289 aa  62.8  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 299 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 291 aa  62  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 290 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 243 aa  62  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4599  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 220 aa  62  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 194 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.24 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  23.92 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  26.82 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1133  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.660169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 217 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  37.96 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  29.12 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
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NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  25.64 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
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NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 229 aa  59.3  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4079  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.780842  normal  0.246764 
 
 
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NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 255 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
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NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
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NC_013521  Sked_28480  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 326 aa  58.5  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.552525 
 
 
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NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
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NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
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NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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