More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1862 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 202 aa  105  5e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 206 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 206 aa  61.2  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0550  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 229 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4006  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 233 aa  55.1  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  41.49 
 
 		 242 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  27.16 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 290 aa  53.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 189 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 231 aa  53.9  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2066  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.612632  hitchhiker  0.000107098 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 287 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3823  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal  0.237924 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 240 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0382  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 242 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.894324  normal  0.190078 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2515  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.745235  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 237 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  24.26 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3792  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3397  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1419  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 190 aa  51.6  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 235 aa  51.6  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1419  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  24.88 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 233 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  22.78 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 226 aa  51.6  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  22.99 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 237 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 233 aa  50.8  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 286 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  22.92 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 280 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 226 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  23.39 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1638  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.181149  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  36.49 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1719  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0591  transcriptional regulator, TetR family  53.49 
 
 		 226 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>