More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1620 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  55.9 
 
 		 196 aa  226  1e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1817  TetR family transcriptional regulator  54.12 
 
 		 195 aa  216  2e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 195 aa  192  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 201 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 200 aa  68.2  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0481  TetR family transcriptional regulator  21.47 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  29.3 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  28.4 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  29.3 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  28.4 
 
 		 196 aa  60.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  29.3 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  29.3 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1668  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  29.3 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  29.3 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  29.3 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 202 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 288 aa  59.7  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4873  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2430  transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  27.65 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 221 aa  58.2  0.00000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  29.41 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4897  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 193 aa  54.7  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.684326  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  24.4 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.11 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 207 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2270  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 233 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 197 aa  52  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 200 aa  52.4  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 223 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003358  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 251 aa  52  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.433364  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  22.87 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 185 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  32.88 
 
 		 211 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2506  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.733789  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4043  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 222 aa  51.6  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  28.34 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4525  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 216 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  46.94 
 
 		 190 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1944  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 234 aa  51.2  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.358022  decreased coverage  0.0015067 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 208 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 261 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2537  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 87 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2110  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0942807  normal  0.362877 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2392  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 198 aa  50.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0101662  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 195 aa  50.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0265  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.250901  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3715  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 208 aa  50.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  24.23 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3751  TetR family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>