More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1811 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 209 aa  416  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  42.56 
 
 		 205 aa  148  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 215 aa  148  7e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  41.92 
 
 		 205 aa  146  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  45.79 
 
 		 211 aa  144  1e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 198 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 222 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 225 aa  134  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 202 aa  130  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  41.36 
 
 		 201 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  43.35 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  38.83 
 
 		 195 aa  121  8e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  37.24 
 
 		 197 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  38.59 
 
 		 211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  36.57 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  41.21 
 
 		 198 aa  115  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  34.38 
 
 		 196 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  36.7 
 
 		 195 aa  111  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 201 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 196 aa  111  8.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 197 aa  109  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  37.85 
 
 		 197 aa  108  7.000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  40.96 
 
 		 192 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 199 aa  104  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  35.6 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  41.04 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  34.95 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 194 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 201 aa  94.7  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  31.09 
 
 		 192 aa  94  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  29.95 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 205 aa  71.2  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 191 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  38.38 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  50 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  36.45 
 
 		 219 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  37.75 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 215 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0324  TetR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 203 aa  65.9  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.720161 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  35.51 
 
 		 223 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 238 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2034  TetR family transcriptional regulator  46.58 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743283  decreased coverage  0.000716409 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  48.19 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 201 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0290  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.547414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  39.64 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  24.73 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  40.59 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 189 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  43.18 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0304  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661097  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1493  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0661  transcriptional regulator, TetR family  48.68 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0312  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 206 aa  62.8  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4830  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.456248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 210 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0085  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0016021  decreased coverage  0.0000722764 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  47.22 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  40.82 
 
 		 217 aa  62  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0687  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 261 aa  62  0.000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.794796  normal  0.223624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 201 aa  62  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  45.83 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  45.83 
 
 		 215 aa  62  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>