More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3694 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  392  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  56.08 
 
 		 196 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0972  transcriptional regulator, TetR family  54.79 
 
 		 194 aa  159  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0921311  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  53.44 
 
 		 192 aa  157  9e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  48.66 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  121  8e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  40.46 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0828  TetR family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  38.07 
 
 		 202 aa  99.8  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  36.87 
 
 		 211 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  95.9  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 205 aa  96.3  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 209 aa  95.5  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2925  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  36.82 
 
 		 195 aa  90.1  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 205 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  36.22 
 
 		 197 aa  87.8  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10078  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.105796 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  38.86 
 
 		 201 aa  86.3  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.82 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 197 aa  81.6  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  35.4 
 
 		 234 aa  81.6  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  34.92 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3520  TetR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.140443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 195 aa  79.3  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3783  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.539516 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  39.87 
 
 		 211 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2693  regulatory protein TetR  33.14 
 
 		 192 aa  72  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0770653  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  52.24 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2845  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.735257  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 201 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0235  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 199 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0309861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3703  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  24.75 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.83778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  51.22 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  28.28 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3406  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.507531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 310 aa  61.6  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3669  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 243 aa  60.8  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.433868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1636  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0571  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.530829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 307 aa  59.3  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2256  TetR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0681818  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  49.09 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6079  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.615867 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 221 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0266  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.437766  hitchhiker  0.000931508 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 210 aa  57.8  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0269  TetR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.60794  normal  0.358976 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 255 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0602  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.5525  normal  0.406937 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  37.86 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2925  TetR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 259 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2162  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 209 aa  56.2  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0662359 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 186 aa  56.2  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.48 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 239 aa  55.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  33.62 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  35.48 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4313  transcriptional regulator, TetR family  33.59 
 
 		 238 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 242 aa  55.5  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1548  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  46.48 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 226 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  30.85 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>