More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2477 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2477  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  380  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3066  TetR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 190 aa  274  6e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.122558 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3293  TetR family transcriptional regulator  70.53 
 
 		 190 aa  271  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00124137 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  62.69 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22500  transcriptional regulator, TetR family  62.63 
 
 		 199 aa  229  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589103  normal  0.921764 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2074  transcriptional regulator, TetR family  55.79 
 
 		 189 aa  213  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 192 aa  211  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 192 aa  209  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2744  TetR family transcriptional regulator  54.26 
 
 		 187 aa  205  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184508  normal  0.510089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  53.97 
 
 		 187 aa  204  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  55.03 
 
 		 186 aa  201  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11503  transcriptional regulator  51.32 
 
 		 187 aa  196  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.243571 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2400  regulatory protein TetR  54.26 
 
 		 198 aa  181  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 198 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  43.75 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  41.38 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  39.19 
 
 		 192 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 204 aa  57.8  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4165  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  57.8  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.774051  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  38.89 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  42.11 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  31.93 
 
 		 221 aa  56.2  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0259  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 346 aa  54.7  0.0000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 200 aa  53.9  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 204 aa  54.3  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4114  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3955  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.915843  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4434  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  26.34 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19820  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 230 aa  52.8  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2903  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.281452  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4231  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0128  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 235 aa  52.8  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 230 aa  52.4  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4067  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 191 aa  52  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.200915  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1372  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.487007  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 220 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 192 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 214 aa  51.6  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 204 aa  51.6  0.000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3694  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.735281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 206 aa  51.6  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 218 aa  51.6  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 232 aa  51.2  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 232 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1138  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4225  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 244 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.127157  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 186 aa  50.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>