More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4557 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 199 aa  387  1e-107  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  62.96 
 
 		 201 aa  208  3e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  61.14 
 
 		 201 aa  206  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  56.35 
 
 		 204 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  58.59 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  58.82 
 
 		 195 aa  195  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  48.97 
 
 		 202 aa  172  1.9999999999999998e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  43.39 
 
 		 204 aa  152  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  44.97 
 
 		 203 aa  144  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  44.33 
 
 		 194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  41.08 
 
 		 198 aa  118  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 205 aa  117  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 214 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 		 209 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  39.77 
 
 		 228 aa  91.7  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 218 aa  89.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  32.47 
 
 		 204 aa  89.7  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 221 aa  87.4  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 224 aa  80.9  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 234 aa  78.6  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 207 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 226 aa  72  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 206 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 195 aa  62  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 310 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 212 aa  58.5  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3251  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.831278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 209 aa  56.6  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2791  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 179 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0498078  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 307 aa  55.1  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  35.88 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.83 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 277 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0145  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.437687  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 219 aa  52.8  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  42.86 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 241 aa  52.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 201 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  31.45 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  34.17 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 242 aa  52  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  38.64 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  27.94 
 
 		 198 aa  51.6  0.000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3731  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  31.45 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  32.26 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  28.43 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  32.26 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  32.26 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2032  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 214 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.874631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  38.67 
 
 		 197 aa  51.6  0.000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3673  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 230 aa  51.2  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2175  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 214 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  25.98 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2968  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.305044  normal  0.85525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>