More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_5494 on replicon NC_011758
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 141 aa  276  5e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  60.47 
 
 		 187 aa  110  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  61.73 
 
 		 192 aa  102  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 190 aa  99.4  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 186 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 188 aa  98.6  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  61.45 
 
 		 186 aa  97.8  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 357 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 187 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  51.11 
 
 		 187 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 187 aa  87  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  36.61 
 
 		 190 aa  70.9  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 191 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  43.22 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 244 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 208 aa  60.5  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  48.48 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 181 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 197 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 224 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 172 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 187 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.16 
 
 		 210 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  48.44 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 203 aa  54.7  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  37.08 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4101  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.899389 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 186 aa  53.9  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 204 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 192 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 213 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 194 aa  53.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 200 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 189 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 204 aa  53.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 202 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 202 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1574  regulatory protein, TetR  32.77 
 
 		 200 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.979673 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  41.46 
 
 		 219 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 180 aa  52.8  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1649  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 233 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.617035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5678  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 205 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  39.78 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 194 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  51.6  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 183 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
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NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  37.29 
 
 		 213 aa  52  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 189 aa  52  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  35.66 
 
 		 230 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 215 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 178 aa  51.6  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 216 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 196 aa  51.6  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
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NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 298 aa  51.6  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 222 aa  51.2  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
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NC_007778  RPB_3651  TetR family transcriptional regulator  46.38 
 
 		 233 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.496262 
 
 
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NC_007958  RPD_1808  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 233 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_1759  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 199 aa  51.6  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  44.23 
 
 		 200 aa  51.2  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
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NC_010623  Bphy_3493  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 211 aa  50.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729173  normal  0.75311 
 
 
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NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 200 aa  50.8  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
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