More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1926 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_1926  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0593  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.65008  normal  0.136354 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 		 236 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4118  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 220 aa  57.8  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 173 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2013  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 173 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  44.23 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2010  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2056  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2609  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000163063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2227  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 180 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.192949  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1991  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 184 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.645683  normal  0.738548 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5773  transcriptional regulator TetR family  32.88 
 
 		 208 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  28.75 
 
 		 232 aa  52.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 74 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4342  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243053 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 216 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 208 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 184 aa  51.6  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 187 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  31.82 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1844  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000808903 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3038  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 230 aa  51.2  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  29.77 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 215 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6450  putative transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 188 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000363867  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 186 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 175 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3892  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4856  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3966  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176455  normal  0.497396 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3878  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.348506 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 233 aa  50.1  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0235  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 225 aa  49.7  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 199 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 438 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3882  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 275 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3937  transcriptional regulatory protein  42.37 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 214 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0940  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 210 aa  49.3  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00130273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2636  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 184 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  31.33 
 
 		 225 aa  48.9  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 193 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 197 aa  48.9  0.00006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 226 aa  48.9  0.00006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 200 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 213 aa  48.5  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 198 aa  48.9  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  31.73 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 324 aa  48.9  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  48.5  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 225 aa  48.9  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7116  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 183 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101346  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5311  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 210 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 205 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 207 aa  48.1  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 211 aa  48.5  0.00009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 242 aa  48.5  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4758  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.939945 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>