More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_12440 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  414  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  99.53 
 
 		 215 aa  412  1e-114  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  76.56 
 
 		 213 aa  288  3e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 209 aa  160  1e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  39.9 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  40.89 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 218 aa  132  6e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03806  transcriptional regulator, TetR family  41.35 
 
 		 206 aa  125  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 205 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2697  transcriptional regulator, TetR family  43.3 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0366203  normal  0.310239 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5945  regulatory protein, TetR  39.57 
 
 		 216 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.542251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6435  TetR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 262 aa  92.8  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.253012  normal  0.0353997 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  32.37 
 
 		 224 aa  84.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 224 aa  79.7  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 250 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 224 aa  71.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4138  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3206  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  28.49 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  30.19 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  29.19 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  29.94 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2774  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0349028  normal  0.98242 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1344  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000662672 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3234  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 335 aa  53.5  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 291 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 286 aa  53.1  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2636  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  41.86 
 
 		 141 aa  52  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11350  transcriptional regulator  25.54 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 198 aa  51.6  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3241  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  27.56 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.11 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 232 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  19.8 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1753  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1690  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 192 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.732657 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 188 aa  50.1  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0400  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 205 aa  49.7  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  22.16 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 216 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2027  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.835752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 214 aa  48.9  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  37.5 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 211 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 324 aa  48.5  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 211 aa  48.5  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 333 aa  48.5  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 190 aa  48.1  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 251 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 251 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  29.79 
 
 		 234 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 199 aa  48.1  0.00009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  48.1  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 241 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1586  transcriptional regulator, TetR family  28.29 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.61 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 252 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  23.78 
 
 		 195 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 241 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>