More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2202 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 186 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  88.59 
 
 		 188 aa  339  2e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  47.83 
 
 		 187 aa  181  5.0000000000000004e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 357 aa  145  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 187 aa  143  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 186 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  40.31 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  41.99 
 
 		 192 aa  134  6.0000000000000005e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  50.6 
 
 		 187 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  37.06 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  58.97 
 
 		 141 aa  98.6  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 199 aa  96.7  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 227 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 191 aa  91.7  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 227 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  34.97 
 
 		 244 aa  89.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 175 aa  88.2  6e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
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NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 201 aa  85.9  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 236 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 		 178 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
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NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.81 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 196 aa  72  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 180 aa  67.8  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 168 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  42.67 
 
 		 234 aa  64.7  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 183 aa  64.3  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.22 
 
 		 179 aa  63.9  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 181 aa  62.8  0.000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  32.03 
 
 		 181 aa  62.4  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 205 aa  61.6  0.000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 186 aa  61.2  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 185 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  40.43 
 
 		 179 aa  59.3  0.00000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 189 aa  58.9  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  43.33 
 
 		 213 aa  58.5  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 206 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  43.94 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 194 aa  58.2  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 172 aa  58.2  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  38.82 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 192 aa  57  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3457  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 238 aa  56.6  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  30.77 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 230 aa  55.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3587  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.997688  normal  1 
 
 
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NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012669  Bcav_3004  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.519568  normal  1 
 
 
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NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 223 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  36.23 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
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NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
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NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
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