More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0041 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  395  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  46.96 
 
 		 187 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  44.27 
 
 		 187 aa  158  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 187 aa  155  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 190 aa  150  8e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  45.29 
 
 		 186 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 357 aa  144  7.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0730  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  40.44 
 
 		 188 aa  138  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  41.99 
 
 		 186 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4428  transcriptional regulator, TetR family  46.84 
 
 		 187 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.89429  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 190 aa  102  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  61.73 
 
 		 141 aa  102  4e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 227 aa  92  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 191 aa  90.5  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 236 aa  89.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 244 aa  90.1  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 201 aa  88.2  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2025  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0232401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 208 aa  81.6  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 181 aa  78.6  0.00000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 179 aa  78.2  0.00000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 178 aa  72  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  32.85 
 
 		 168 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2002  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.700466  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0953  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 184 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.712721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 203 aa  67.8  0.00000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 185 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 178 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 179 aa  66.2  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  35.92 
 
 		 186 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 172 aa  63.5  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4488  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.14916  normal  0.0536152 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  33.6 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  29.51 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 243 aa  57.8  0.00000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  37.8 
 
 		 234 aa  57.8  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2783  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 177 aa  57  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 181 aa  56.2  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 		 188 aa  56.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 415 aa  54.3  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  29.56 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 205 aa  53.5  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 177 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 185 aa  51.6  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 428 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  38.75 
 
 		 211 aa  51.6  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 206 aa  50.4  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  26.36 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4797  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00913075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  39.68 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 226 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 202 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 227 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 200 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  37.93 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 214 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 215 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 205 aa  48.9  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4330  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 235 aa  48.9  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2360  regulatory protein, TetR  29.22 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.173305 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  27.22 
 
 		 190 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  29.07 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1935  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.551285  hitchhiker  0.00334969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>