274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2175 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2175  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  420  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1090  TetR family transcriptional regulator  74.59 
 
 		 188 aa  287  8e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1051  TetR family transcriptional regulator  74.59 
 
 		 188 aa  287  8e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2620  TetR family transcriptional regulator  47.72 
 
 		 194 aa  161  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.727172  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2801  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 189 aa  92.4  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 189 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 179 aa  88.6  6e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1153  TetR family transcriptional regulator  43.22 
 
 		 189 aa  87  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 208 aa  84.3  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0981  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1451  transcriptional regulator, TetR family  30.29 
 
 		 428 aa  74.7  0.0000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 181 aa  74.7  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2114  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 183 aa  74.3  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.328011  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2794  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1320  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.010897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3701  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 178 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.076632  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4211  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.954356 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3260  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 187 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.323175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2157  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1840  transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 415 aa  67.8  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3009  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 187 aa  67  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5248  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 178 aa  67  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2329  TetR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2389  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.979129  normal  0.861655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2560  putative transcription regulator protein  30.07 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0102643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2686  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.39833  hitchhiker  0.00361312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1094  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 168 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1991  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2202  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.243165 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3570  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 175 aa  60.8  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00083347  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  29.41 
 
 		 186 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5162  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 193 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.186575 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  41.11 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5492  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  44.12 
 
 		 179 aa  57.4  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  49.21 
 
 		 172 aa  57.8  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  51.72 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  28.82 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3984  TetR family transcriptional regulator  25.54 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2940  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2192  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8111  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 168 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 192 aa  53.5  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5991  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 244 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0553876 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48420  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0011363  normal  0.230392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0286  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 177 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.945519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 181 aa  52  0.000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2152  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 185 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4896  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6105  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.93473  normal  0.666323 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3267  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4974  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0603654 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6545  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.129926 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5866  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1884  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652086  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 178 aa  50.4  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2113  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 182 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6061  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 191 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.660328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5697  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 227 aa  49.7  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.949992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4433  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3347  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 187 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.084846  normal  0.752924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7518  TetR family transcriptional regulator  52 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2324  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  27.89 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6911  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 187 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4161  putative transcriptional regulator  31.34 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2479  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 230 aa  48.5  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 223 aa  48.5  0.00007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1059  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.659814 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6843  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.163651  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4350  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02650  transcriptional regulator, tetR family  44.78 
 
 		 179 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5031  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0201359  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  29.31 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5829  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6861  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 187 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3535  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.926686  normal  0.288543 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3073  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2182  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>