More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3584 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  37.44 
 
 		 201 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 201 aa  98.2  8e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  34.9 
 
 		 194 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 235 aa  89.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  34.91 
 
 		 205 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 235 aa  89.7  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 199 aa  89.7  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  33.89 
 
 		 214 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 218 aa  85.1  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  32.98 
 
 		 198 aa  84.7  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 209 aa  80.9  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  72  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 234 aa  69.7  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  33.08 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 221 aa  68.9  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  35.11 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 207 aa  64.7  0.0000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  36.89 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 188 aa  57.8  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0439  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  28.79 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3328  regulatory protein, TetR  39.29 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 141 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 201 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2546  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.768933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 185 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 189 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2349  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 357 aa  52.8  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00426882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  21.61 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 190 aa  52.4  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 125 aa  52  0.000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0538  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0069  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 191 aa  52  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2497  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 201 aa  51.6  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.55388 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  28.87 
 
 		 201 aa  51.6  0.000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3936  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0494347  normal  0.157135 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  25.31 
 
 		 269 aa  51.2  0.000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  30.99 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  28.87 
 
 		 198 aa  51.2  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3054  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 126 aa  51.2  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0108952 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  32.91 
 
 		 278 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 172 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1067  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.530116 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0186  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.625871  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4342  regulatory protein TetR  42.67 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0872  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.956466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4711  transcriptional regulator, TetR family  42.67 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.492793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 243 aa  50.1  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1819  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0041  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  35.29 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13730  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.839534  normal  0.161793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 222 aa  49.3  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>