More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_1206 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  100 
 
 		 194 aa  384  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  52.45 
 
 		 205 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  46.39 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  43.01 
 
 		 198 aa  122  2e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  44.79 
 
 		 201 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 204 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  47.88 
 
 		 195 aa  118  7e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  43.71 
 
 		 214 aa  110  9e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  40.11 
 
 		 202 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  40.57 
 
 		 207 aa  105  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 221 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  41.81 
 
 		 209 aa  100  1e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 234 aa  99.4  3e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  34.9 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  33.5 
 
 		 204 aa  96.7  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 236 aa  91.3  8e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  41.11 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 218 aa  84.7  8e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  41.22 
 
 		 228 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 224 aa  82.4  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  34.03 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 207 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 226 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  39.23 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 223 aa  64.7  0.0000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 242 aa  58.2  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0052  transcriptional regulator, TetR family  41.98 
 
 		 188 aa  53.5  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.612692  normal  0.466149 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  44.26 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2838  transcriptional regulator, TetR family  37.63 
 
 		 183 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  37.36 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3794  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.549336  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3867  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 191 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0211824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 225 aa  52.4  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3798  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 191 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164802  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7672  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 198 aa  51.2  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.245363  normal  0.688993 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 200 aa  51.2  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 190 aa  50.4  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 332 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 219 aa  50.4  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 310 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2482  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.57 
 
 		 197 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 243 aa  49.7  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1332  transcriptional regulator BetI  28.83 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.945819  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2969  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  34 
 
 		 251 aa  49.7  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  39.29 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  21.25 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  42.47 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  32.93 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3030  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.94 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 224 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3341  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1572  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 228 aa  49.7  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2442  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.510523  normal  0.120027 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0827  transcriptional regulator, TetR family  27.07 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.843783  normal  0.883408 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 209 aa  48.9  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 235 aa  49.3  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  44.07 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  37.5 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4773  regulatory protein TetR  34.29 
 
 		 184 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550217  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0763  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.673415  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3711  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.644349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5284  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0597036  normal  0.356444 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  28.32 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0369  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.87327 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3954  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4469  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>