116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12926 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 195 aa  389  1e-107  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 199 aa  62  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  34.9 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  28.82 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 236 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 204 aa  55.1  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 214 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  29.41 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 217 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 209 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  25.58 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 204 aa  49.3  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  28.21 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 204 aa  48.5  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 244 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 222 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  39.73 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 234 aa  46.6  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 242 aa  47  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  34.29 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 217 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1588  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 235 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.472704 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1444  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 225 aa  45.1  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0101817  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 210 aa  45.1  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 206 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 211 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0005  TetR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 218 aa  43.9  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0576727  normal  0.763846 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46290  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 210 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128988  normal  0.0344421 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06181  transcriptional regulator BetI  32.86 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  27.63 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 191 aa  44.3  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 198 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3190  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.0000000548437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  31.65 
 
 		 197 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  32.32 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0022  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 224 aa  43.5  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  29.06 
 
 		 197 aa  42.7  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0300  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 214 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.948594  normal  0.297799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 201 aa  42.7  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 243 aa  43.1  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0820  putative transcription regulator protein  29.79 
 
 		 225 aa  42.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1093  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 217 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0694796  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3096  TetR family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0203472  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4215  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.582437  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4281  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.439471  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 200 aa  42.4  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4442  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 229 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.67 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2129  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 210 aa  42.4  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  42.7  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.67 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4024  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 199 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.497962  normal  0.530155 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.67 
 
 		 218 aa  42.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 223 aa  42.4  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 204 aa  42.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 239 aa  42.4  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  26.67 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5773  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6138  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.890581 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 234 aa  42  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 208 aa  42  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 187 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 198 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 198 aa  42  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 204 aa  42  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  31.36 
 
 		 251 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>