156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_4996 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_4996  transcriptional regulator  100 
 
 		 197 aa  398  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4968  transcriptional regulator, TetR family domain protein  95.43 
 
 		 197 aa  383  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2734  putative transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 206 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  0.79417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  38.92 
 
 		 198 aa  88.2  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  32.99 
 
 		 208 aa  87  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2067  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.580158 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 240 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0039  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9078  putative transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  30 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2290  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0794358  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5060  transcriptional regulator BetI  27.5 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0255482 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8404  putative transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 677 aa  56.6  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3293  transcriptional regulator, TetR family  26.89 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0372  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0328  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3310  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0344  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0375  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0868398 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00269  transcriptional regulator BetI  26.89 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.547366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00272  hypothetical protein  26.89 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.418668  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3513  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 195 aa  53.9  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.809024  normal  0.394338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1513  transcriptional regulator BetI  30.59 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0564912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0435  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 		 217 aa  53.9  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.839793 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1834  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 196 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353647 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  25 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  31.4 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2829  transcriptional regulator BetI  33.73 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  36.84 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2556  transcriptional regulator BetI  32.35 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.160785  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 196 aa  51.6  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  26.04 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1590  transcriptional regulator BetI  32.26 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0483  transcriptional regulator BetI  33.33 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  37.29 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  24.28 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5242  transcriptional regulator BetI  31.76 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.0512317 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  22.83 
 
 		 196 aa  48.9  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 211 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 298 aa  48.1  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1516  transcriptional regulator BetI  28.79 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.026336  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1824  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882089  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70970  transcriptional regulator BetI  30.59 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.790986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 208 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1871  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.516108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1805  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.386636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6159  transcriptional regulator BetI  30.59 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4880  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 215 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3905  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4935  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5113  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0491395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0403  transcriptional regulator BetI  31.82 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.714996 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  24.05 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  23.31 
 
 		 196 aa  46.2  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0440  regulatory protein BetI  35.71 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4734  transcriptional regulator BetI  35.71 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.448537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 200 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0081  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  21.29 
 
 		 224 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000366  HTH-type transcriptional regulator BetI  24.55 
 
 		 194 aa  45.1  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1727  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0492221  normal  0.584646 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0961  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0186381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  24.78 
 
 		 224 aa  44.7  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1720  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1169  transcriptional regulator, TetR family  25.52 
 
 		 214 aa  43.9  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 202 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 216 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  22.5 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2545  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 201 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.91976e-46 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>