More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1697 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  407  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1535  transcriptional regulator, TetR family  45.64 
 
 		 204 aa  181  5.0000000000000004e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1567  TetR family transcriptional regulator  43.15 
 
 		 202 aa  157  8e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.246189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 219 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 203 aa  101  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2740  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 230 aa  98.6  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0291953  hitchhiker  0.000390237 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0191  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 243 aa  96.7  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00113557  decreased coverage  0.000257741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  25.52 
 
 		 193 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30.87 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0411  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 196 aa  62  0.000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.3269  hitchhiker  0.00212654 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1526  transcriptional regulator, TetR family  50.94 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000234923  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2461  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.460998  normal  0.536684 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1502  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.385487  normal  0.318035 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0319  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.89 
 
 		 222 aa  58.2  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2689  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2746  regulatory protein TetR  29.07 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01665  transcriptional regulator  29.01 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.152407  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4193  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 291 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 194 aa  57.4  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  36.23 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  24.87 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1427  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.286714  hitchhiker  0.000126282 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 324 aa  56.2  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  23.3 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.85 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1703  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.188958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2798  TetR family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 251 aa  54.7  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.358212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0833  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 190 aa  54.7  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3062  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0638813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  27.83 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  28.49 
 
 		 287 aa  53.9  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  23.26 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2120  transcriptional regulator, TetR family  21.46 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0824  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3666  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.356922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.99 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.99 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  26.99 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.99 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  26.99 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.99 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2583  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 184 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 196 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0068  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 185 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139926 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  28.24 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 185 aa  53.1  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0995  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.713352  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 204 aa  52.8  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 190 aa  52.8  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  26.99 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0502  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 221 aa  52.8  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1479  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  29.58 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  23.75 
 
 		 198 aa  52.8  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 188 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2177  transcriptional regulator, TetR family  48.39 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.480454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 332 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1553  regulatory protein, TetR  36.19 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 72 aa  52  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2292  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.030142  hitchhiker  0.00610108 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6397  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.467706 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0184  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 206 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10440  transcriptional regulator  32.31 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0189255  normal  0.0235057 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 226 aa  52  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>