279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1564 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1564  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 228 aa  461  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.127259  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4763  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 201 aa  99  6e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.781145  decreased coverage  0.0000189499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4323  regulatory protein, TetR  37.88 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0245964 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  41.22 
 
 		 194 aa  92  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  43.71 
 
 		 205 aa  91.7  8e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 214 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2258  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 218 aa  87.8  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0562664  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  86.3  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24710  transcriptional regulator, tetR family  35.87 
 
 		 198 aa  85.9  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 195 aa  81.3  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3418  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 234 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111441  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4436  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  77.8  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0578844 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 224 aa  78.2  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0268  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  36.89 
 
 		 204 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16550  transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.882037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  45.16 
 
 		 203 aa  71.6  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  55.38 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2273  TetR family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.702073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4004  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0894492  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 204 aa  69.7  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2908  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.906058 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0992  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 226 aa  66.6  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000245295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 207 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4581  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 235 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712688 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5875  transcriptional regulator, TetR family  36.94 
 
 		 218 aa  64.3  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5205  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.155344  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5654  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.346197  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 211 aa  62.8  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3524  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0849134 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4678  TetR family transcriptional regulator  25.43 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1348  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.593778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  30.09 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 217 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0662  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4772  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 184 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  36.11 
 
 		 222 aa  52  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 189 aa  50.8  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1778  transcriptional regulator, TetR family  43.33 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1372  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 		 193 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0306025  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  37.88 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0925  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 211 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  35.59 
 
 		 186 aa  49.3  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4359  regulatory protein, TetR  44.07 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00193568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6001  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 224 aa  48.5  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.903994  normal  0.20153 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 414 aa  48.5  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0868  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 222 aa  48.5  0.00009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000486929  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 224 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  30.4 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 264 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1759  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5494  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 141 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.769028  normal  0.39499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2327  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.215572  normal  0.48242 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 291 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  36.84 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0046  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 217 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1498  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 189 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.437225  normal  0.170332 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 185 aa  46.6  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4406  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.732992  normal  0.0232179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 332 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1811  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 209 aa  46.6  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1719  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 272 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.7573  hitchhiker  0.00027252 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2518  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.382378  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 263 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>