238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1141 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  85.71 
 
 		 201 aa  342  2e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  53.09 
 
 		 194 aa  188  5e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 190 aa  164  8e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2902  regulatory protein, TetR  32.17 
 
 		 253 aa  58.5  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.271799  normal  0.100562 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 187 aa  55.1  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 232 aa  53.5  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  32.85 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 191 aa  52.4  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1705  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 203 aa  51.6  0.000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 184 aa  51.6  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 192 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10790  hypothetical protein  32.12 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  53.49 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2617  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 207 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.923721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 197 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 278 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.68 
 
 		 221 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 205 aa  48.9  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2899  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.06 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2811  putative DNA-binding transcriptional regulator  47.06 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  27.75 
 
 		 510 aa  48.5  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12926  TetR family transcriptional regulator  24.47 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.394038 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  25.61 
 
 		 222 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1989  hypothetical protein  40.79 
 
 		 226 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00163154  normal  0.392807 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3469  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 258 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 250 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 219 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4314  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.316546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 277 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 193 aa  47.4  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  29.92 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  29.68 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0175  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 232 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000233696  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 220 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1517  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 372 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  28.41 
 
 		 208 aa  46.2  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  32.89 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0928  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 461 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384359  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 216 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  32.89 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 239 aa  45.8  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  32.89 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  32.89 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  32.89 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 291 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  32.89 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  32.89 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 181 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6831  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.1423  normal  0.362364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 244 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 219 aa  45.1  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.411668  normal  0.665917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 204 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2823  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 208 aa  45.1  0.0008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00548665  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 209 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3159  putative transcriptional regulator, TetR family  29.9 
 
 		 221 aa  44.3  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>