More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1978 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  367  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1141  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 218 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.864063  hitchhiker  0.000033846 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3893  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 194 aa  159  3e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0918047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1252  regulatory protein, TetR  48.47 
 
 		 201 aa  148  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.409819  normal  0.484115 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 215 aa  62.8  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10333  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0410  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 195 aa  58.2  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0177  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.775643 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1768  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 181 aa  57  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0908345  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4304  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.498529  normal  0.0930958 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2560  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 225 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391327  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9138  putative transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 217 aa  55.1  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1293  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 199 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1697  hypothetical protein  25.98 
 
 		 199 aa  52.8  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  33.64 
 
 		 213 aa  52.4  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 		 195 aa  52  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3555  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1610  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 202 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 209 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 184 aa  51.2  0.000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1337  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 182 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5705  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 291 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  22.9 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2630  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0697093  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 332 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0794  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  23.2 
 
 		 208 aa  49.7  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  22.83 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0104  transcriptional regulator  24.82 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000798599  hitchhiker  0.000000102912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2779  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.441306  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2904  TetR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 255 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  26.46 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3510  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1672  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 184 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5148  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 199 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5570  transcriptional regulator, TetR family  36.07 
 
 		 198 aa  48.9  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2948  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000720602  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5101  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.375326  normal  0.313411 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31710  hypothetical protein  34.38 
 
 		 189 aa  48.5  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.547253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1508  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 215 aa  48.5  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0994502  normal  0.123569 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.58 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5020  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294081  normal  0.0543061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3265  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.111309  normal  0.286417 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0101  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  23.9 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19020  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 197 aa  48.1  0.00007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 221 aa  48.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 223 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  38.24 
 
 		 222 aa  47.8  0.00009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 250 aa  48.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  22.82 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  24.69 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 280 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 204 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.66 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  28.57 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1330  putative DNA-binding transcriptional regulator  29.6 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.745262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 221 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 239 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2036  transcriptional regulator, TetR family  52.5 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.49858  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>