More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5376 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 198 aa  95.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 206 aa  91.7  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2551  regulatory protein TetR  32.1 
 
 		 190 aa  85.5  5e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40790  putative transcriptional regulator  32.61 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3522  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3536  TetR family transcriptional regulator  31 
 
 		 208 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2527  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.490074  normal  0.267005 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3459  putative transcriptional regulator  32.07 
 
 		 193 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0331  transcriptional regulator, TetR family  26.4 
 
 		 209 aa  71.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0658  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2387  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1771  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0807  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1176  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1100  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 204 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10241  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000764085  normal  0.925652 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 214 aa  61.2  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1600  TetR family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2310  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.145827  normal  0.0377448 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  24.23 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 192 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2712  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5420  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.66162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3501  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.191946  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4865  TetR family transcriptional regulator  42.22 
 
 		 209 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1896  transcriptional regulator, TetR family  32.18 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.589186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 189 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 213 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1256  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000259056 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 241 aa  53.5  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2129  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.101154  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  40.26 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 186 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.04 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 188 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1978  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000899637  hitchhiker  0.000000574301 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3677  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503409  normal  0.650375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 216 aa  52.4  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 193 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  36.11 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  21.94 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 		 188 aa  51.6  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 218 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 224 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  23.95 
 
 		 206 aa  51.6  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2906  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0722139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  32.69 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0377  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.294343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  35.05 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0257  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102981 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 219 aa  50.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  22.56 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  27.66 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  35.79 
 
 		 183 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  29.81 
 
 		 216 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 218 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  26.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  26.21 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  19.19 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2669  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 226 aa  49.3  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00411812  normal  0.199475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>