199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3378 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  100 
 
 		 196 aa  387  1e-107  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 199 aa  259  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  66.16 
 
 		 199 aa  257  6e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  66.16 
 
 		 199 aa  257  6e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  63.78 
 
 		 201 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  65.64 
 
 		 206 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  37.23 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 193 aa  105  6e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  36.04 
 
 		 203 aa  95.5  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 194 aa  94  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  32.98 
 
 		 213 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 193 aa  91.3  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 209 aa  89.4  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  35.5 
 
 		 202 aa  89  4e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 213 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 200 aa  88.2  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 228 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 245 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 230 aa  80.5  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 209 aa  80.1  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 222 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  37.72 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 224 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 229 aa  77  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 211 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 218 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 221 aa  71.6  0.000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  33.33 
 
 		 165 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  29.86 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 217 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 221 aa  65.5  0.0000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  43.94 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 221 aa  51.6  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  25.51 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  25.81 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 243 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5168  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  29.73 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 213 aa  47  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5257  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  34.31 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 226 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5549  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.63 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.91 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.86 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  32.86 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 291 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.04 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  32.86 
 
 		 234 aa  45.8  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.04 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 218 aa  45.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 290 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  33.91 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>