100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2287 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2287  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.101004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  80.29 
 
 		 226 aa  326  2.0000000000000001e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1708  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.64 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000453712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03580  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.02 
 
 		 197 aa  141  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.163329  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002153  unsaturated fatty acid biosythesis repressor FabR  43.62 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000110455  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00264  DNA-binding transcriptional repressor FabR  43.62 
 
 		 213 aa  137  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0230  DNA-binding transcriptional repressor FabR  43.09 
 
 		 205 aa  137  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000220471  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2369  DNA-binding transcriptional repressor FabR  43.62 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000123396  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0124  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.36 
 
 		 205 aa  134  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000427607  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0335  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.58 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0192  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.31 
 
 		 204 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0188643  normal  0.031406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0129  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.15 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.555645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4339  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.31 
 
 		 205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000022912  hitchhiker  0.00000127177 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2889  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.02 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0433096  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3786  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.15 
 
 		 212 aa  129  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0189  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.67 
 
 		 213 aa  129  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.368893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0137  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.9 
 
 		 205 aa  129  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00297198  normal  0.372296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4197  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.19 
 
 		 215 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00988726  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0172  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.291893  normal  0.0249459 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0177  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0234685  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0198  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4031  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.41 
 
 		 199 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5426  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.19 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0614494  normal  0.10498 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4023  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4023  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.19 
 
 		 213 aa  128  5.0000000000000004e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23914  normal  0.0336938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3541  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.018845  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0195  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.15 
 
 		 213 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.685771  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03848  DNA-binding transcriptional repressor  42.19 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03797  hypothetical protein  42.19 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0112282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4504  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.19 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00559066  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0178  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00155373  normal  0.944765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4053  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.19 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.506107  normal  0.0185922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4410  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.19 
 
 		 234 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0500651  normal  0.0177189 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4449  DNA-binding transcriptional repressor FabR  42.19 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.563556  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4711  DNA-binding transcriptional repressor FabR  39.79 
 
 		 204 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000633687  normal  0.0908035 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4078  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00684362  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0175  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0116142  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0179  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00396424  normal  0.0559762 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4180  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.96 
 
 		 204 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0026827  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0163  DNA-binding transcriptional repressor FabR  40.31 
 
 		 225 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000509997  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4773  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.67 
 
 		 212 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00222933  hitchhiker  0.00284138 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0139  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.15 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0390891  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0120  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.15 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102544  normal  0.553113 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4076  DNA-binding transcriptional repressor FabR  41.15 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1493  DNA-binding transcriptional repressor FabR  35.64 
 
 		 202 aa  102  5e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.132494  normal  0.0684627 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  33.67 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 210 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3068  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 207 aa  93.6  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0906512  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0359  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 233 aa  92  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 210 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 232 aa  84.7  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1578  regulatory protein TetR  30.99 
 
 		 231 aa  84.3  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.358729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 211 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1730  regulatory protein, TetR  32.49 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 211 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 222 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5663  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 214 aa  81.6  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4816  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 244 aa  81.6  0.000000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0244477 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1626  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 222 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0432632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0564  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0896844  normal  0.626016 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5613  hypothetical protein  29.35 
 
 		 209 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64640  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0210921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1257  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1283  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20735  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1274  TetR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 224 aa  75.1  0.0000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.941811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44540  hypothetical protein  26.98 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.508928  normal  0.389288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3792  hypothetical protein  27.27 
 
 		 279 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3820  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1912  TetR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000376024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0892  hypothetical protein  27.43 
 
 		 226 aa  60.8  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.303522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1526  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.97703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1272  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2619  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 235 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0254896  normal  0.89864 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 285 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 220 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  32.71 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2397  regulatory protein, TetR  28.71 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  41.38 
 
 		 219 aa  43.1  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3750  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.178814  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 205 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 194 aa  42.4  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 200 aa  42  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 209 aa  42.4  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  30.69 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 242 aa  42.4  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 200 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 246 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  27.4 
 
 		 213 aa  42  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 185 aa  42  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2536  putative transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 215 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 218 aa  41.6  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>