93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5084 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 193 aa  392  1e-108  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  91.71 
 
 		 193 aa  341  4e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 194 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 194 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  75.65 
 
 		 194 aa  307  8e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  69.43 
 
 		 213 aa  284  5.999999999999999e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  45.21 
 
 		 202 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 		 194 aa  149  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 211 aa  135  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  35.86 
 
 		 196 aa  105  6e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 206 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 224 aa  91.3  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  33.16 
 
 		 244 aa  87.8  9e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 211 aa  77.4  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 241 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  75.9  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 228 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 245 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 209 aa  72  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  28.5 
 
 		 222 aa  67.8  0.00000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  30.37 
 
 		 219 aa  67.8  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 200 aa  67.4  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 209 aa  67  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 230 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 221 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 217 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 218 aa  67  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 216 aa  67  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 213 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  33.08 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 229 aa  54.7  0.0000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 221 aa  54.3  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  29.87 
 
 		 165 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 220 aa  51.6  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  31.4 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  32.79 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 305 aa  48.1  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 248 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3861  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5471  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5585  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 200 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5040  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5024  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5189  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5433  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.944120000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5518  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.142065  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5463  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 209 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000220885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5489  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.152228  hitchhiker  8.2338e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5138  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 209 aa  44.7  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 196 aa  44.7  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 205 aa  42.7  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03880  transcriptional regulator TetR family  36.36 
 
 		 226 aa  42.7  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.568548  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3610  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.140089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2995  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 211 aa  42.4  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.428403  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0686  transcriptional regulator, TetR family  36.21 
 
 		 247 aa  42  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 199 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 195 aa  41.6  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  35.09 
 
 		 202 aa  41.6  0.007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0858  regulatory protein TetR  30.1 
 
 		 201 aa  41.6  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00117784  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1972  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 		 203 aa  41.6  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000120212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>