39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0409 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



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Alignment on homolog gene
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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  100 
 
 		 165 aa  330  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  84.24 
 
 		 209 aa  258  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  65.85 
 
 		 241 aa  224  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  64.42 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  64.42 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  64.42 
 
 		 205 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  39.33 
 
 		 244 aa  106  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  84.3  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  84  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 199 aa  84  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  34.04 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 224 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  32.45 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 211 aa  62  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 203 aa  60.1  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  37.36 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 193 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 224 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 194 aa  50.8  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 230 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 221 aa  45.1  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  23.24 
 
 		 201 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 229 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
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