192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_5109 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_5109  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  395  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.313188  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  86.08 
 
 		 206 aa  324  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  81.63 
 
 		 199 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  81.63 
 
 		 199 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  81.63 
 
 		 199 aa  313  9e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3378  regulatory protein TetR  63.78 
 
 		 196 aa  244  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4521  hypothetical protein  37.43 
 
 		 244 aa  113  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4510  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.576125  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4597  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.908107 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4893  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0909608  normal  0.312291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3200  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.415485  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3262  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.376016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3209  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 224 aa  96.7  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22680  transcriptional regulator  36.41 
 
 		 202 aa  95.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5084  TetR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 193 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 211 aa  92  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3563  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10840  hypothetical protein  32.81 
 
 		 213 aa  87.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.96162e-38  hitchhiker  0.00000829572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10279  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 241 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000004651  normal  0.205699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 228 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 245 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4630  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 213 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1669  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 193 aa  77.8  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0313  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 213 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0331  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0436  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 230 aa  74.7  0.0000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0367  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0377  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0356  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1283  TetR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.299217  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4594  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 211 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.780124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4631  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3855  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 213 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.898863  normal  0.650046 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4696  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3666  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 218 aa  72.4  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0498574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4611  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 224 aa  71.6  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2442  TetR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 218 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0816  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 221 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5042  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.449178  normal  0.617447 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0444  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5414  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 218 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0432  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 222 aa  68.9  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147068  hitchhiker  0.000000839635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0102  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1073  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1263  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1540  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 221 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.608661  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2819  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2672  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0121  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 211 aa  66.6  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0409  FadD27  34.25 
 
 		 165 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0405  TetR family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 222 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  39.47 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2901  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.781877  normal  0.0527686 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1526  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0607  putative transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 194 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.174677  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 211 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4846  regulatory protein TetR  36.72 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4918  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5216  TetR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999138  hitchhiker  0.00983469 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  40.7 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 305 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 221 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 254 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27 
 
 		 237 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 249 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2956  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 220 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  27.19 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 290 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 290 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 225 aa  47.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
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NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  47  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
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NC_013757  Gobs_4828  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  32.77 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
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NC_002947  PP_3960  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.110455  normal  0.471806 
 
 
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NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
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NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
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NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  39 
 
 		 218 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
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NC_009512  Pput_1866  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 201 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.115406 
 
 
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NC_009565  TBFG_13066  AsnC family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 246 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.117427 
 
 
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NC_009668  Oant_2924  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.480778  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 228 aa  45.8  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
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