More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 227 aa  453  1e-127  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  55.87 
 
 		 218 aa  219  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  54.46 
 
 		 224 aa  211  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  47.87 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  43.81 
 
 		 222 aa  168  5e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  41.55 
 
 		 231 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 241 aa  141  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 225 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0659  transcriptional regulator TetR family  32.84 
 
 		 196 aa  61.6  0.000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  41.56 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 200 aa  57.4  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00415  DNA-binding transcriptional repressor  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3146  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0376592  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0507  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.480121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0498  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0396  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00420  hypothetical protein  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0540  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0554  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.627816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3152  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.56 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3296  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.791383 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0527  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0521  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36.36 
 
 		 217 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0327711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  28.92 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 		 214 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3694  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 287 aa  54.7  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 210 aa  54.3  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  40.35 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  43.33 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  27.64 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  39.18 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3221  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 232 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 190 aa  53.5  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  37.93 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 185 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  34.92 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 195 aa  52.8  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4341  putative transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 210 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.13823  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  42.37 
 
 		 221 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 202 aa  52.4  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2016  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 194 aa  52  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0982631  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 214 aa  52  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 209 aa  52  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 223 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 213 aa  52  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 198 aa  52  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 190 aa  51.6  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>