More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0205 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



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Fosmid unclonability p-value
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PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0204  TetR family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 191 aa  133  1.9999999999999998e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0122947  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0099  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0469573  hitchhiker  0.000212753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4675  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3571  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 227 aa  115  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.713371  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4103  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 215 aa  115  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0350269  normal  0.346351 
 
 
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NC_008321  Shewmr4_3899  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3991  TetR family transcriptional regulator  37.87 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0546493 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  37.97 
 
 		 220 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0066  TetR family transcriptional regulator  37.17 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  hitchhiker  0.0000133916 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4339  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4479  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.2045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4284  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000936887 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0059  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 215 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0273669  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3900  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 215 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.113348  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 218 aa  109  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0108  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 213 aa  109  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 218 aa  108  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3708  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.59565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0103  TetR family transcriptional regulator  34.22 
 
 		 225 aa  108  6e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.462043 
 
 
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NC_008345  Sfri_3937  transcriptional regulator, TetR family protein  34.22 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.353211  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5344  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 223 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0267  HTH-type transcriptional regulator, tetR-family  32.35 
 
 		 214 aa  107  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  35.29 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3614  regulatory protein, TetR  37.23 
 
 		 215 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2735  TetR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.329672  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 221 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2030  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0233695  normal  0.74062 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5169  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 215 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  33.16 
 
 		 215 aa  102  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3239  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 241 aa  101  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1320  transcriptional regulator, TetR family  37.65 
 
 		 241 aa  101  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  normal  0.281979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4186  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00128  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002240  transcriptional regulator TetR family  34.07 
 
 		 211 aa  99.8  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1005  TetR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 244 aa  95.1  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2189  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.533648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2311  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 251 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.287882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2296  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 252 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1661  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 252 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2273  TetR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 252 aa  94.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0843228  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0761  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1265  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0388  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 235 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1410  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0318904  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1037  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.397518  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1272  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 239 aa  94.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.492888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5600  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 252 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.806355 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 236 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 239 aa  91.7  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 236 aa  90.5  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1105  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 253 aa  89.7  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1857  TetR family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 239 aa  89.4  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2086  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5452  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 220 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.44369 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1960  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 199 aa  82  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  81.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1293  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 213 aa  80.5  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4170  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 220 aa  80.1  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0130344  normal  0.052898 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  79  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  32.58 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 206 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0535  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 217 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0588697 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0551  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 220 aa  78.2  0.00000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0825  TetR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 222 aa  77.4  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 204 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 237 aa  75.5  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4167  TetR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3496  TetR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.591625 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3888  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 206 aa  73.2  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.693202 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1581  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.223478 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3529  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.270662  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  31.72 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4025  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 219 aa  70.1  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.272144  normal  0.300768 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1491  TetR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  35.34 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1089  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 227 aa  67.4  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.485393  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01158  transcriptional regulator PhaD  37.86 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.334041  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1684  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
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NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  48.15 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
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NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
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NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
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NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
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NC_011886  Achl_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 181 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_002976  SERP2292  intercellular adhesion regulator  47.92 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0364892  n/a   
 
 
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NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 189 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
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NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 222 aa  54.7  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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