295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1311 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1311  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 241 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  58.02 
 
 		 220 aa  201  9.999999999999999e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  48.42 
 
 		 224 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0595  TetR family transcriptional regulator  46.41 
 
 		 218 aa  183  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4896  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  39.57 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0168  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 224 aa  96.7  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  23.65 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0439  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0458  transcriptional regulator, TetR family  26.98 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 197 aa  54.7  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 192 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 193 aa  52  0.000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1211  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2237  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00985462  hitchhiker  0.00000967235 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1118  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 201 aa  51.6  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00548751  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 224 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 324 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 497 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 203 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  43.55 
 
 		 213 aa  49.7  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 188 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1807  TetR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 218 aa  49.7  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.237257  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 190 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2089  transcriptional regulator, TetR family  40.22 
 
 		 220 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0021127  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  32.61 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 196 aa  48.9  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 223 aa  48.9  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 205 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  42.47 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3896  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 202 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.673039  normal  0.0314346 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0652  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 190 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00127288  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1100  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 196 aa  48.1  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40 
 
 		 196 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 205 aa  47.4  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28060  transcriptional regulator  34.29 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.633688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 212 aa  47.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0369  transcriptional regulator, TetR family  45.16 
 
 		 204 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.238864 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  37.1 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 199 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  31.3 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1177  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 190 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1191  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 198 aa  47  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2883  transcriptional regulator, TetR family  56.82 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.256454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6448  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 222 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264064  hitchhiker  1.59583e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 234 aa  46.6  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  24.51 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 196 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 188 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  34.18 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 202 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4506  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0817  TetR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577348  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  47.17 
 
 		 196 aa  46.6  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4593  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.10871  normal  0.699268 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4889  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 198 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  38.27 
 
 		 221 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 199 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 188 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 188 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 188 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1112  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 188 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2189  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 222 aa  45.8  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2672  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4194  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1473  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 187 aa  46.2  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 188 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 247 aa  45.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3172  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 198 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>