More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0596 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  409  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 209 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 202 aa  151  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 222 aa  148  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  43.85 
 
 		 222 aa  147  8e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 207 aa  140  9e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 194 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 196 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  40.1 
 
 		 210 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 206 aa  128  5.0000000000000004e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 195 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 208 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 209 aa  120  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 200 aa  111  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  35.51 
 
 		 145 aa  72  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1767  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.271955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0225  TetR family transcriptional regulator  43.28 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.512739 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  26.15 
 
 		 510 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0483  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1502  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 241 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4006  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  41.67 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 227 aa  53.1  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 178 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06115  transcriptional regulator TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.131749  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1639  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 215 aa  52.4  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01051  transcriptional regulator TetR family  37.5 
 
 		 210 aa  52.4  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.250197  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1718  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.114077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4603  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 240 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1655  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal  0.229233 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 201 aa  51.6  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2820  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  31.3 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4107  transcriptional regulator  42.25 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.198218  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4015  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.345828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2395  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 205 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.431985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 229 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1312  regulatory protein, TetR  28.02 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406176 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0212  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.581109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2710  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 231 aa  48.9  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3229  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.446849 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47610  putative transcriptional regulator  40.85 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3298  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.436817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4328  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 477 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0701267  normal  0.0216349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4438  transcriptional regulator, TetR family  27.2 
 
 		 477 aa  48.1  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.829211  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1953  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.957288  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1805  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.754817  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1275  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.033456  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1958  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00062632  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1784  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 316 aa  47.4  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.261379  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7555  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 414 aa  47.8  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.838529  normal  0.947596 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1743  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 244 aa  47.4  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.065917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0133  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.221572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2528  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 317 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0660251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 215 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  34.92 
 
 		 246 aa  47.8  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1033  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.781792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4798  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1762  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 318 aa  47.4  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0114483  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4086  putative transcriptional regulator, TetR family  29.75 
 
 		 237 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 244 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0666  transcriptional regulator  35.59 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 202 aa  46.2  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3711  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 220 aa  46.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1842  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 189 aa  46.6  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1889  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1823  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 226 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 213 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>