280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7104 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  53.93 
 
 		 210 aa  215  4e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5300  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 208 aa  201  9e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.104655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4918  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141388  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5007  TetR family transcriptional regulator  50.25 
 
 		 208 aa  200  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.324898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  48.69 
 
 		 206 aa  199  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1270  TetR family transcriptional regulator  47.74 
 
 		 208 aa  191  5e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0484434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3239  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 200 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.845515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0716  TetR family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 223 aa  164  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0951056 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4140  TetR family transcriptional regulator  39.38 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.355658  normal  0.167189 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2518  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 209 aa  150  8.999999999999999e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3662  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3735  TetR family transcriptional regulator  35.6 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.717952  normal  0.477586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3675  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0505657  normal  0.850178 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2972  TetR family transcriptional regulator  40.93 
 
 		 207 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3373  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 211 aa  145  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4791  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.131161 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0331  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0341  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.317306 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1588  TetR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0320  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0596  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3220  putative regulatory protein  37.04 
 
 		 145 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7816  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3421  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 205 aa  57  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5603  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 188 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4909  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.194586  decreased coverage  0.000378041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  39.24 
 
 		 198 aa  52  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6386  regulatory protein, TetR  24.66 
 
 		 510 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3932  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 179 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.324595  normal  0.0870807 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0452  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.681881  decreased coverage  0.00000297509 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9052  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 193 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0477  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 204 aa  48.5  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5772  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6137  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.8739 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0479  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.676411  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0381  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1810  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 239 aa  48.1  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5714  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.297365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1114  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.213128 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5956  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.341434  normal  0.49488 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6619  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.634361  normal  0.119433 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 221 aa  48.5  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4293  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 188 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0268101  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3637  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 228 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1492  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4291  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2194  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.881672  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0681  transcriptional regulator, TetR family  29.77 
 
 		 167 aa  47.8  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0989844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1480  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  24.49 
 
 		 221 aa  47.8  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3407  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 178 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0796  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1502  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2113  TetR family transcriptional regulator  25.37 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.473372  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7671  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.403599  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2774  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0059  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 186 aa  46.6  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33.75 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6065  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  36.62 
 
 		 186 aa  47  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0810  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 268 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1993  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00019531  normal  0.0761383 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 230 aa  46.2  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1164  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000872016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2776  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.556184  normal  0.492186 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 231 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  36.14 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1498  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.548232  normal  0.295378 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2892  regulatory protein, TetR  41.43 
 
 		 635 aa  46.2  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.794047  normal  0.565465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 193 aa  46.2  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  30.65 
 
 		 287 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7871  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.519364  normal  0.175428 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5561  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 196 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.842065 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 216 aa  45.4  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06539  hypothetical protein  30.34 
 
 		 218 aa  45.4  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 211 aa  45.4  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>