289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4907 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



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Organism name
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Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  388  1e-107  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1513  TetR family transcriptional regulator  88.27 
 
 		 196 aa  331  5e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  0.703699 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4423  TetR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4510  TetR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4804  TetR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 207 aa  239  2e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  56.02 
 
 		 200 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 201 aa  209  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  58.15 
 
 		 200 aa  205  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  52.79 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4416  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4503  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 202 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.437982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4797  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 220 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 204 aa  53.9  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  45.31 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  29.68 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 205 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0102  transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.351493 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 242 aa  52.4  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 187 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1509  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0671702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2880  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.924779 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0397  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.188282 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2810  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.226856  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  48.21 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3217  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3782  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 179 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.59056  normal  0.419733 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000716  transcriptional regulator  48.15 
 
 		 175 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.421465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0409  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0418  TetR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.602911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 335 aa  48.5  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  42.19 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 184 aa  48.5  0.00007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0706  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 210 aa  48.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3089  TetR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 194 aa  48.1  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.544244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2902  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 187 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.465511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1978  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 179 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0203016  normal  0.0208763 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1764  TetR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.162555 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5150  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 204 aa  47.8  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.491017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 212 aa  47.4  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 192 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2384  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 187 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  38 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 200 aa  47.4  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  42.59 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 		 213 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 192 aa  46.6  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_7104  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007336  Reut_C6064  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007492  Pfl01_2770  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 195 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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