More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4416 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_4503  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.437982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4416  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 202 aa  403  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4797  TetR family transcriptional regulator  99.5 
 
 		 220 aa  402  1e-111  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  76 
 
 		 200 aa  313  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 201 aa  309  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  55.56 
 
 		 200 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  52.82 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 196 aa  194  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4510  TetR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4423  TetR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4804  TetR family transcriptional regulator  59.47 
 
 		 207 aa  179  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1513  TetR family transcriptional regulator  54.74 
 
 		 196 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  0.703699 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  27.22 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.22 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.22 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  27.22 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  27.22 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  27.22 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.22 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.17 
 
 		 198 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 		 193 aa  53.9  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  43.9 
 
 		 206 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  23.84 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  49.12 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 222 aa  52.4  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3500  transcriptional regulator, TetR family  30.82 
 
 		 209 aa  52  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00016281 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 203 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 182 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 212 aa  51.6  0.000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  38.96 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 206 aa  51.2  0.000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  44.93 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3319  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00311946  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5646  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 233 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.176197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 189 aa  50.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 290 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  33.06 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 207 aa  49.3  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 192 aa  49.7  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  39.29 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2036  regulatory protein, TetR  35.56 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.284785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4578  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.127543  normal  0.45553 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2308  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 200 aa  48.9  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.594902 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 269 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 189 aa  48.9  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 199 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 223 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0361  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.23201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>