More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4973 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4973  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 201 aa  400  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0231413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1774  TetR family transcriptional regulator  84 
 
 		 200 aa  347  8e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4797  TetR family transcriptional regulator  75.5 
 
 		 220 aa  291  6e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.718458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4416  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 202 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4503  TetR family transcriptional regulator  75 
 
 		 202 aa  288  3e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.437982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4907  TetR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 196 aa  209  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.724417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  57.87 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4572  TetR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 208 aa  202  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.270475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4804  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.499136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4423  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4510  TetR family transcriptional regulator  56.35 
 
 		 207 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1513  TetR family transcriptional regulator  54.97 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  0.703699 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  32.48 
 
 		 231 aa  61.6  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  29.75 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1456  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 203 aa  53.9  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  29.14 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1648  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.298566  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2496  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 198 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2004  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00390576  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 187 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.86 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  26.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.86 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  26.86 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.86 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.86 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  26.86 
 
 		 192 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  26.86 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2014  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0449612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2169  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  52  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000817381  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3959  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00461459  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1012  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.156612  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 192 aa  52  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2229  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00028806  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1986  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000218655  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1968  TetR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 189 aa  52  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2312  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000153851  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3545  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 192 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7226  putative transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 259 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 259 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 259 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 192 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0589  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 191 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 205 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0989  TetR family transcriptional regulator  48.21 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5130  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.943479  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3836  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 204 aa  50.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 182 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 250 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0457  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 180 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1879  TetR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 179 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  42.65 
 
 		 196 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 195 aa  49.3  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 246 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 221 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 176 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0987  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.995143  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3550  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 209 aa  48.9  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123962  normal  0.200142 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 216 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3066  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.283852  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2881  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.531949 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3206  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  36 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  34.67 
 
 		 227 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 254 aa  48.5  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2910  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4836  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 193 aa  48.1  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 206 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>