More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3540 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  497  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 257 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  59.24 
 
 		 254 aa  263  3e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  61.4 
 
 		 237 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 259 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 259 aa  251  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  57.21 
 
 		 241 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 288 aa  124  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  35.89 
 
 		 217 aa  112  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 290 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  36.32 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4909  TetR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 237 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.69589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  36.13 
 
 		 223 aa  93.6  3e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 217 aa  90.9  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 222 aa  90.5  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  39.01 
 
 		 210 aa  86.3  4e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 275 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 233 aa  74.3  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 204 aa  73.2  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  48.53 
 
 		 209 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3028  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.851198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  43.55 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  40.3 
 
 		 221 aa  55.8  0.0000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0030  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.100703  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 203 aa  55.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3299  transcriptional regulator, TetR family  25.62 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000002111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  32.65 
 
 		 213 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2475  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 197 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.000212819  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1000  regulatory protein, TetR  25.97 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.6882 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1792  regulatory protein, TetR  35.71 
 
 		 238 aa  54.3  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  43.08 
 
 		 200 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0261  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00036521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3760  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5974  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0426648  hitchhiker  0.00085933 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  38.67 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  27.87 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  35.97 
 
 		 211 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 201 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7459  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 233 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.626167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  32.98 
 
 		 213 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  31.52 
 
 		 210 aa  53.5  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0511  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 194 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0871  transcriptional regulator, TetR family  46.77 
 
 		 219 aa  53.1  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 225 aa  53.5  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 204 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 211 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4468  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 		 200 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4265  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 228 aa  53.1  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.752062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 196 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 209 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0262  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000117006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 201 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0123  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  41.27 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 203 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 192 aa  52  0.000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1014  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 212 aa  52  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3663  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 201 aa  52  0.000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.579152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1428  TetR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 204 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.530378  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3363  TetR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0676561  hitchhiker  0.0000000000000226443 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 217 aa  52  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 241 aa  52  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 224 aa  52  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32320  transcriptional regulator, TetR family  42.25 
 
 		 200 aa  51.6  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 193 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1286  transcriptional regulator, TetR family  37.84 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000123202 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2892  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.39024 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>