More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_2444 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_2444  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 211 aa  430  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0505938 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  72.16 
 
 		 200 aa  296  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0170  transcriptional regulator, TetR family  68.18 
 
 		 201 aa  275  5e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.307357  hitchhiker  0.00190078 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  63.78 
 
 		 200 aa  255  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3870  transcriptional regulator, TetR family  59.79 
 
 		 208 aa  241  7e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0541518  normal  0.262725 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25250  transcriptional regulator  48.48 
 
 		 190 aa  176  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.862967  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  34.63 
 
 		 201 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0566  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0703  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 		 216 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  32.14 
 
 		 219 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  93.2  3e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 220 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3566  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 241 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3548  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2235  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 235 aa  58.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.170733  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6288  transcriptional regulator, TetR family  48.28 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2785  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.256269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 237 aa  57  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1470  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.772741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  31.1 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3088  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.215093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3148  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.435592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4604  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3108  TetR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90259  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3228  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00722998  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 254 aa  54.7  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 225 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0667  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 232 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.764927  normal  0.0361684 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3845  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 209 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00359694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 		 188 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 239 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4859  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 211 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.203125  hitchhiker  0.0000563821 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4737  TetR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0397829  hitchhiker  0.000000987598 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2996  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 237 aa  52.8  0.000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4652  TetR family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.104872  hitchhiker  0.00491998 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3008  transcriptional regulator, TetR family  51.92 
 
 		 280 aa  52.4  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 188 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 224 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 217 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 188 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07230  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.350601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4916  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00715752  hitchhiker  0.000000000695443 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 202 aa  52  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0334  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 226 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.202617  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0370  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 193 aa  51.6  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 250 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 205 aa  51.6  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0622  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1159  regulatory protein, TetR  39.13 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3456  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.659534  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1904  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 228 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1950  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663338  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 185 aa  51.2  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1035  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 227 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.168916  normal  0.097412 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  27.36 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  25.2 
 
 		 251 aa  50.8  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>