More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2521 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  46.24 
 
 		 204 aa  161  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  43.52 
 
 		 213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  45.74 
 
 		 200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 212 aa  119  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 193 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 193 aa  112  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 201 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 192 aa  103  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  38.73 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 213 aa  99  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  37.71 
 
 		 220 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 185 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  34.22 
 
 		 228 aa  94.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  35.26 
 
 		 243 aa  91.3  8e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 211 aa  90.1  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 206 aa  90.1  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 196 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  30.26 
 
 		 213 aa  79.3  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  26.22 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  58.9  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0828  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 235 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  31 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 211 aa  54.7  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3788  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.263954  normal  0.238282 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 201 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 243 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 202 aa  53.9  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35560  transcriptional regulator  27.61 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.85 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  33.02 
 
 		 307 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0432  TetR family transcriptional regulator  54 
 
 		 237 aa  53.1  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3195  transcriptional regulator, TetR family  26.56 
 
 		 200 aa  52.8  0.000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 224 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  22.88 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 250 aa  52.8  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 239 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0381  TetR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1005  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  33.68 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  26.99 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  30.61 
 
 		 237 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01587  DNA-binding transcriptional repressor  26.99 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2330  transcriptional regulator UidR  26.99 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1693  transcriptional regulator UidR  26.99 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  25.76 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01577  hypothetical protein  26.99 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.98021  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6254  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.170118  normal  0.0153866 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2012  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.952906  normal  0.615913 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4693  transcriptional regulator  51.11 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53550  transcriptional regulator  51.11 
 
 		 227 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00980972  decreased coverage  0.0000958508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2024  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.180766  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1550  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 221 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0750  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0322855 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1581  transcriptional regulator UidR  27.22 
 
 		 192 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  38.81 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 228 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1826  transcriptional regulator UidR  27.39 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1805  transcriptional regulator UidR  27.39 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.947665  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3570  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.649978  decreased coverage  0.00133713 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  29.48 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2775  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0212844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>