More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3146 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  402  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  60 
 
 		 211 aa  232  2.0000000000000002e-60  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 202 aa  177  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 209 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  42.05 
 
 		 212 aa  148  4e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 212 aa  141  7e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 201 aa  118  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 195 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 195 aa  104  8e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0358  regulatory protein, TetR  31.25 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000667156 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  36.18 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 231 aa  71.2  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  39.17 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  29.3 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  55 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 228 aa  62  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 398 aa  62.4  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 288 aa  62  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3090  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 218 aa  62  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.595832  hitchhiker  0.000923351 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 376 aa  61.2  0.000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  27 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  36.25 
 
 		 211 aa  60.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  32.6 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  31.06 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  50.77 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  21.98 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  52.31 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2980  TetR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05643  putative transcription regulator protein  49.06 
 
 		 233 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  23.75 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 242 aa  57.4  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  38.53 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  30.61 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2962  TetR family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  23.59 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3016  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.150997  normal  0.125451 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00750  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.935342  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  28.89 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 497 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  23.62 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0507  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.982351 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  24.1 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1825  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  46.88 
 
 		 237 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  26.81 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  39.44 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  36.27 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 208 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 207 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  29.1 
 
 		 307 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2767  transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.430405  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  30.3 
 
 		 220 aa  52.8  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 424 aa  52.8  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 203 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  27.15 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 		 269 aa  52.4  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 190 aa  52.8  0.000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4925  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 228 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.791426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 196 aa  52.4  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 		 231 aa  52.4  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  27.11 
 
 		 202 aa  52  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>