More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1538 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



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Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 222 aa  444  1.0000000000000001e-124  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 237 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 257 aa  87  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3516  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 259 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 241 aa  72  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3022  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7278  Transcriptional regulator  28.91 
 
 		 216 aa  67.8  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3748  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0727  transcriptional regulator, TetR family  33 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 223 aa  62  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  55.36 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 		 205 aa  61.6  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2817  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318929  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3329  transcriptional regulator, TetR family  31.94 
 
 		 217 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.181798  normal  0.116616 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  37.97 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2028  TetR family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.578288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  59.57 
 
 		 204 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  62.79 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3750  TetR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3095  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000942813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 286 aa  55.5  0.0000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5567  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5130  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5288  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5685  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5615  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5529  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 290 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5390  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.787919  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  46.81 
 
 		 291 aa  55.1  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5113  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 290 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3952  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 291 aa  54.7  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5559  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 289 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5185  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0034  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.345685  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0034  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5674  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.166194  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4561  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.286179  normal  0.0846577 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2128  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 		 202 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.190242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1534  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.114781  normal  0.468022 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0024  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4543  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0569885  normal  0.220748 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 228 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 226 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0348  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 198 aa  53.1  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1657  regulatory protein, TetR  30.19 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.184352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 233 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1499  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 310 aa  53.5  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  36 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  25.83 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4148  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  26.7 
 
 		 226 aa  52.8  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1275  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3822  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.526815  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 191 aa  52.4  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_5228  TetR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 290 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
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NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
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NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_3578  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 198 aa  52.4  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00935563  normal  0.0256006 
 
 
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NC_011004  Rpal_0747  putative transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 187 aa  52.4  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.24477  n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  35.94 
 
 		 208 aa  52.4  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
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NC_007492  Pfl01_0683  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000557469  normal  1 
 
 
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NC_002947  PP_1968  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000902359 
 
 
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NC_007953  Bxe_C0628  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 262 aa  52  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0323336 
 
 
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