More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2703 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 228 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 228 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  43.15 
 
 		 211 aa  131  9e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  43 
 
 		 203 aa  126  3e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 224 aa  122  4e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  37 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  37.76 
 
 		 200 aa  118  9e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  42.13 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 218 aa  96.3  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 207 aa  76.6  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  27.98 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  25.89 
 
 		 288 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 211 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 231 aa  61.6  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 223 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  25.49 
 
 		 242 aa  58.5  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 204 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 248 aa  58.2  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 257 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  25.71 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  28.45 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 222 aa  56.2  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1601  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3734  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3746  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.29443  normal  0.952036 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3807  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.225103  normal  0.0640685 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  32.39 
 
 		 224 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0320964 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1264  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.599329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 205 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3412  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.430092  normal  0.661157 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19890  transcriptional regulator  25.3 
 
 		 346 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.403358  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 217 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 211 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3354  transcriptional regulator, TetR family  44.64 
 
 		 210 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.216649  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4199  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 290 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 398 aa  52.8  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3938  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 231 aa  52.8  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00284915  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 203 aa  52.8  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 190 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  31.13 
 
 		 194 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0984  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 245 aa  52.4  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.50937  hitchhiker  0.00233885 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 199 aa  52  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  33.87 
 
 		 211 aa  52  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3722  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.869277  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3795  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  52  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796114  normal  0.124585 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3734  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 202 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0165853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 237 aa  51.6  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2710  transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448517  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1416  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.305494  hitchhiker  0.0000141576 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2460  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315446  normal  0.37249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1027  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 207 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  27.88 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2525  transcriptional regulator, TetR family  21.83 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.905424  hitchhiker  0.00170542 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1121  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 221 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2809  transcriptional regulator, TetR family  22.34 
 
 		 203 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.167328  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3736  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.042499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4724  regulatory protein, TetR  28.09 
 
 		 191 aa  50.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2297  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 305 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0935054  hitchhiker  0.00257224 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1253  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989157 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 209 aa  50.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  35.8 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  29.27 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3797  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.388195  normal  0.0386626 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2373  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 205 aa  50.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>