More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3405 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 207 aa  432  1e-120  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 218 aa  125  5e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  30.81 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 211 aa  99.4  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 213 aa  90.9  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  33.5 
 
 		 211 aa  84.7  9e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 223 aa  75.9  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 205 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 200 aa  69.3  0.00000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 212 aa  68.2  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 228 aa  67.8  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  23.17 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 242 aa  62.8  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 209 aa  62.4  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 212 aa  61.6  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 196 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 297 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  34.41 
 
 		 196 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  26.45 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4666  TetR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 214 aa  54.7  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.441468  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  26.35 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 269 aa  54.7  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 497 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3161  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000174477  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  24.1 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1120  transcriptional regulator, TetR family  26.01 
 
 		 223 aa  52.8  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.917457  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 209 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 230 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 178 aa  51.6  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  37.88 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 207 aa  51.2  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 231 aa  50.8  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1632  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 239 aa  50.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0743  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5928  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.511087  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 196 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1769  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 198 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 224 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6828  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196798  normal  0.216852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3621  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.941769  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2789  transcriptional regulator  26.53 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4440  transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 236 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.25 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  42.86 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0231  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 200 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.336394 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  22.99 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 210 aa  48.9  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3008  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 324 aa  49.3  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1086  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 239 aa  48.9  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.566372  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 230 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 208 aa  48.5  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 206 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4194  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 201 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 195 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0736  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 194 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0116381  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  32.81 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5011  putative transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0804167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>