94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2639 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2639  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  428  1e-119  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4627  regulatory protein TetR  36.23 
 
 		 207 aa  119  3e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0956  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 218 aa  66.2  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0905948 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  24.74 
 
 		 213 aa  55.1  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 218 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0963  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 214 aa  52  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.553529  normal  0.247244 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  33.93 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 214 aa  51.6  0.000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.26 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 209 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4193  transcriptional regulator, TetR family  31.34 
 
 		 302 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0423044  normal  0.257514 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5887  TetR family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5146  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 209 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 207 aa  50.1  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5684  TetR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 224 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000982546 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4122  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.389931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 228 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13891  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2300  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 229 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 210 aa  47.4  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 217 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 242 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  22.53 
 
 		 497 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 219 aa  47.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2592  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 205 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000712719  hitchhiker  0.00165626 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 200 aa  46.6  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  38.89 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0209  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.234614  normal  0.228688 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4217  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.152492 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2291  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 216 aa  45.8  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 223 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  23.67 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 203 aa  45.8  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 213 aa  45.8  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  25.97 
 
 		 196 aa  45.4  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3195  regulatory protein  22.83 
 
 		 181 aa  45.1  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1656  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 196 aa  45.1  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0515046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0972  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.93446  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  24.14 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1932  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1957  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0421083  normal  0.138407 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2656  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000478919  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1137  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1217  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0153  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1372  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2738  TetR family transcriptional regulator  21.1 
 
 		 181 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000104447  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4450  regulatory protein, TetR  39.68 
 
 		 210 aa  43.5  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.870367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1961  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 213 aa  44.3  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.310052  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13075  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.576817 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 254 aa  43.1  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0971  TetR family transcriptional regulator  23.56 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3481  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 189 aa  43.1  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.148181  normal  0.311825 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  37.18 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 184 aa  42.7  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4037  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 446 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.755951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 238 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 200 aa  42.4  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3167  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 236 aa  42.4  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0319866  normal  0.111754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0974  TetR family transcriptional regulator  23.7 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0073  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  26.43 
 
 		 203 aa  42  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1156  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 193 aa  42  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.813518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 201 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  23.74 
 
 		 197 aa  42  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  27.31 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 198 aa  41.6  0.008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 231 aa  41.6  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4908  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  23.17 
 
 		 199 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 175 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 249 aa  41.6  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>