More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1600 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 288 aa  587  1e-167  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 297 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 209 aa  74.7  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  27.72 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2368  TetR family transcriptional regulator  25.76 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000142624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 195 aa  67  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 219 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  24.02 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 249 aa  64.3  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3449  TetR family transcriptional regulator  24.17 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.772262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  23.65 
 
 		 211 aa  64.7  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  21.88 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2592  transcriptional regulator, TetR family  25.81 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.119823  normal  0.0690788 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 240 aa  62.4  0.000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 269 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  19.69 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2304  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.373552  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1430  transcriptional regulator, MerR family  45.71 
 
 		 210 aa  60.1  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.130007  normal  0.485128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2479  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4711  TetR family transcriptional regulator  21.39 
 
 		 228 aa  59.7  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.133874 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  28 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1620  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.0021024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1426  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0803354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0557  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000848982 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3721  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 260 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249433  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1365  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 192 aa  58.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  28.1 
 
 		 226 aa  58.5  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2226  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0397604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 203 aa  58.5  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 196 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  23.62 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  34.25 
 
 		 264 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2510  TetR family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00262483  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  21.94 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 193 aa  57.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  21.46 
 
 		 241 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0026  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 201 aa  58.2  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000327076  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4955  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.868884 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2272  TetR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000566042  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2575  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000582548  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2500  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  22.93 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 284 aa  57  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  22.54 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  25.27 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7113  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 240 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  23.23 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1015  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3710  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  24.39 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2644  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.773011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4583  putative transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal  0.302497 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 211 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  26.7 
 
 		 207 aa  55.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 195 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  27.45 
 
 		 226 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 188 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 224 aa  55.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  21.55 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1313  transcriptional regulator TetR family  23.76 
 
 		 213 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0153  TetR family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 210 aa  54.7  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  39.34 
 
 		 203 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2970  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.642297  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 194 aa  54.3  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3092  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 185 aa  54.7  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0725563 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  17.48 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  38.24 
 
 		 217 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 188 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2210  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 185 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.222597  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  19.67 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 195 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  28.26 
 
 		 195 aa  53.9  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 195 aa  53.9  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  21.76 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 204 aa  53.9  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 214 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>