53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10277 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  100 
 
 		 206 aa  425  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  65.84 
 
 		 212 aa  277  8e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  35.15 
 
 		 213 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  35.78 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 211 aa  98.2  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 206 aa  88.2  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 206 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 242 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  46.88 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  52.83 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 223 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 214 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22050  transcriptional regulator  40 
 
 		 199 aa  46.2  0.0003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0903673 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  23.35 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1843  transcriptional regulatory protein  27.01 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  40.3 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2686  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  26.19 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  29.84 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 196 aa  43.9  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7250  transcriptional regulator, TetR family  49.06 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  41.43 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  23.43 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  43.4 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 204 aa  42  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 212 aa  42  0.006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 199 aa  42  0.006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  32.73 
 
 		 194 aa  41.6  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  27.75 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 193 aa  41.6  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0395  regulatory protein TetR  46 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.796791 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0464  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 211 aa  41.6  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4778  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329745 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 204 aa  41.6  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3923  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 214 aa  41.6  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  24.67 
 
 		 180 aa  41.6  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  32.73 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0428  transcriptional regulator, TetR family  46 
 
 		 211 aa  41.6  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  51.16 
 
 		 228 aa  41.2  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>