99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_0406 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_0406  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  436  1e-121  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10277  transcriptional regulator  65.84 
 
 		 206 aa  262  4e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.133301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  39.49 
 
 		 213 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  36.41 
 
 		 199 aa  118  7.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 206 aa  102  6e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 211 aa  92.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  87  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1611  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0181002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1587  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.568163  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1557  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 205 aa  85.1  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.873387  normal  0.65945 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 242 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 228 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  36.63 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1290  AcrR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 199 aa  48.1  0.00008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2236  TetR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 211 aa  47.4  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.226682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11567  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 225 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  39.44 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 229 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2786  transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 		 190 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.06199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  33.04 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2624  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 214 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.373378  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1927  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00399738  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1788  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 195 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000202922  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23590  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 180 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0142024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1963  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 201 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000168283 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1156  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 227 aa  45.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1999  putative transcriptional regulator  27.13 
 
 		 180 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 213 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1745  TetR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 195 aa  45.1  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0399082  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0314  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  29.66 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1401  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.505278 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 228 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  44.3  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  22.42 
 
 		 184 aa  43.5  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  23.35 
 
 		 195 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1520  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.431113 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3393  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 263 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158575  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  25.44 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  22.98 
 
 		 234 aa  43.1  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4778  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00329745 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  28 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5054  putative transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.613298 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 208 aa  43.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2732  TetR family transcriptional regulator  27.48 
 
 		 179 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.748169 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 195 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3233  TetR family transcriptional regulator  47.22 
 
 		 193 aa  42.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.659753 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0132  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 204 aa  42.7  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.410533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 197 aa  42.7  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1694  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 219 aa  42.4  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0960426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  41.94 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3126  TetR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.333802  hitchhiker  0.00150199 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 187 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2965  TetR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 224 aa  42.4  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0278757  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4366  transcriptional regulator, TetR family  39.58 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00655225  normal  0.460481 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1522  regulatory protein TetR  28.96 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.485337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1541  TetR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 179 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.932149  normal  0.0804871 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  38.36 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 186 aa  42.4  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 211 aa  42.4  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 212 aa  42.4  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1801  transcriptional regulator, TetR family  28.96 
 
 		 207 aa  42.4  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0882167  normal  0.119004 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 210 aa  42.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3603  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.162578  normal  0.242533 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 207 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0074  TetR/AcrR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 211 aa  42  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2546  TetR family transcriptional regulator  21.9 
 
 		 223 aa  42  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.275318  decreased coverage  0.00000294801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 215 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  37.1 
 
 		 221 aa  42  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 205 aa  42  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5473  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 201 aa  41.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.968436  normal  0.0284284 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 310 aa  41.6  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 200 aa  41.6  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  44.9 
 
 		 212 aa  41.6  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 202 aa  41.2  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2204  regulatory protein, TetR  24.38 
 
 		 235 aa  41.6  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 195 aa  41.2  0.01  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>