More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2565 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 248 aa  504  9.999999999999999e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2904  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 213 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.349703 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3405  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0751749 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1152  transcriptional regulator, TetR family  28.09 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0954  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4111  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 211 aa  62.4  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.856223  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 211 aa  62  0.000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 202 aa  62  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 249 aa  61.6  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2085  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0696  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3856  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 335 aa  57.4  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  29.74 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0005  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0931339  normal  0.381518 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  30.83 
 
 		 242 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0316  putative transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1709  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.400859  normal  0.0301663 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 206 aa  55.8  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  30.93 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 288 aa  55.5  0.0000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0848  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000568716  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1458  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.121951 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1845  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.025211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3775  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 324 aa  54.7  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1372  TetR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027491 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03122  DNA-binding transcriptional regulator  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.889925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2788  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000644753  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 398 aa  54.3  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0442  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.114804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 286 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  40.28 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03073  hypothetical protein  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.807649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 		 217 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3647  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0126984  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  36.25 
 
 		 221 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0737  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 209 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4581  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.12 
 
 		 220 aa  54.3  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00305215  normal  0.159786 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2568  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.21232  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 242 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2524  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000581245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4043  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 		 228 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.168546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3548  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2754  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.864254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  28.12 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 218 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2762  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000444516 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3581  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 242 aa  52.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1940  TetR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.688335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 228 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 217 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2489  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 203 aa  52.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.371609  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0013  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 424 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0542947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2703  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 228 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 217 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3998  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 205 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0825494  normal  0.0160725 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 217 aa  52  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 247 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 255 aa  52  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 		 218 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1866  transcriptional regulator, TetR family  41.56 
 
 		 207 aa  52  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  33.33 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  37.14 
 
 		 264 aa  52  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2324  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000190708  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  35.82 
 
 		 217 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2560  TetR family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.282393  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2543  TetR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 217 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  31.76 
 
 		 204 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>