More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2048 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_2048  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
249 aa  507  1e-143  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4404  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 
213 aa  71.6  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1751  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6341  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0497044  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0764  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000222329 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1738  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
206 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1659  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 
206 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1659  TetR family transcriptional regulator  41 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3376  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
197 aa  59.7  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423093  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1521  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 
206 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.375612 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2290  TetR family transcriptional regulator  57.14 
 
 
206 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.721121  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  40.7 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5087  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
196 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.305126  normal  0.842071 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2102  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.526616  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0955  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
212 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2294  TetR family regulatory protein  37.89 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2161  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 
206 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.720901  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
206 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5297  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
197 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.755351  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3475  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 
197 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.213074  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5693  transcriptional regulator, TetR family  38.3 
 
 
211 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0563608  normal  0.866587 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1515  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
213 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
224 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5034  TetR family transcriptional regulator  53.57 
 
 
206 aa  55.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.553825 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4103  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
209 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4208  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 
213 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.826614 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  31.31 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  28.23 
 
 
200 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0111  transcriptional regulator, TetR family  33.62 
 
 
207 aa  53.9  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.482364  normal  0.0755622 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 
250 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2753  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3299  regulatory protein, TetR  27.88 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0424651 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 
222 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5280  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
175 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  37.08 
 
 
204 aa  53.5  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
220 aa  53.5  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
324 aa  53.9  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1734  TetR family transcriptional regulator  28.05 
 
 
210 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.657322  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 
193 aa  53.1  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 
201 aa  53.1  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000301704  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7136  transcriptional regulator, TetR family  40.79 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00720754  normal  0.217815 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2291  transcriptional regulator, TetR family  53.7 
 
 
205 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.857741  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4004  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
196 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.638592  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4322  TetR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
198 aa  52.8  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136212  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
209 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1969  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 
205 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0320964 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0012  putative AcrAB operon repressor transcription regulator protein  41.54 
 
 
219 aa  52.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.631075  normal  0.0464367 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
211 aa  52.8  0.000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1119  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
213 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2482  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
196 aa  52.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2067  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 
216 aa  52.4  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 
254 aa  52.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3524  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
187 aa  52.4  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 
239 aa  52  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 
223 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1367  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
181 aa  51.6  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
194 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2788  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
201 aa  51.6  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0483  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  42.19 
 
 
223 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4680  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 
236 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  30.65 
 
 
200 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 
197 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
197 aa  52  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1078  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 
211 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4242  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 
200 aa  50.4  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 
332 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3273  TetR family transcriptional regulator  29.47 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.346529  normal  0.756983 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 
198 aa  50.8  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1736  transcriptional regulator TetR family  31.25 
 
 
197 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2411  transcriptional regulator, TetR family  39.39 
 
 
205 aa  50.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.147912 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1746  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1753  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1727  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113561  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1793  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
225 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1800  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.865555  normal  0.363073 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3742  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 
192 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  35.38 
 
 
210 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  44.29 
 
 
222 aa  50.4  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3896  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 
211 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0606  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.288267  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1049  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
230 aa  50.1  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0599696  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  37.35 
 
 
199 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
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NC_012912  Dd1591_3493  transcriptional regulator, TetR family  26.73 
 
 
193 aa  50.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.74894  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_0619  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
194 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.594999  normal 
 
 
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NC_013595  Sros_3836  putative transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 
179 aa  50.4  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0612117 
 
 
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