More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0064 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0167  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 213 aa  72.8  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0754  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 273 aa  63.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4073  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2708  TetR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  41.1 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  46.55 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 438 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 240 aa  58.9  0.00000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4245  regulatory protein, TetR  38.75 
 
 		 221 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  30.71 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 205 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4467  TetR family transcriptional regulator  55.77 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0963408 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  45.59 
 
 		 218 aa  57.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 222 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1323  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0607  transcriptional regulator, TetR family  39.36 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118397  normal  0.590685 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  26.07 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  26.15 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1979  TetR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 193 aa  55.8  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  28.89 
 
 		 200 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  40.59 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0648  transcriptional regulator, TetR family  41.77 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0672593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0698  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00682473  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3613  regulatory protein, TetR  37.5 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 770 aa  55.1  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 258 aa  55.1  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0498  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 208 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0525706  normal  1 
 
 
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NC_013131  Caci_0166  transcriptional regulator, TetR family  36.63 
 
 		 221 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0611363  normal  1 
 
 
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NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 222 aa  55.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4062  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 216 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  41.82 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 204 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4216  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 215 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4218  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.566415  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1551  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 227 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.386957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  46.27 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3407  TetR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0155576  normal  0.84746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0736  transcriptional regulator  26.39 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0112088  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  37.18 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1893  TetR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  48.94 
 
 		 192 aa  53.9  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 188 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 198 aa  53.5  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 233 aa  53.5  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3652  regulatory protein TetR  51.11 
 
 		 188 aa  53.5  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2375  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  43.94 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2422  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.04833  normal  0.11925 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 203 aa  53.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2416  TetR family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.112157  normal  1 
 
 
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NC_009664  Krad_4087  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 228 aa  53.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.98142 
 
 
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NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 216 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
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NC_007511  Bcep18194_B0850  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 209 aa  53.1  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0204358 
 
 
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NC_013947  Snas_0931  transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.588864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0533  TetR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 398 aa  52.8  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0165878  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 215 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0970  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 203 aa  53.1  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 193 aa  53.1  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008752  Aave_3134  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.471149  normal  1 
 
 
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NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 196 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_2883  TetR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010003  Pmob_0503  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 376 aa  52.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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