More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_4113 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  477  1e-134  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4083  TetR family transcriptional regulator  61.72 
 
 		 214 aa  254  9e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.843798  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4281  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130087  normal  0.428776 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 197 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1484  TetR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 205 aa  68.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1486  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1508  TetR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  31.28 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3399  TetR family transcriptional regulator  58.18 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0861975  normal  0.425291 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0372  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.462449 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3973  regulatory protein TetR  40 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.425796  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4956  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0932682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4911  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  35.33 
 
 		 185 aa  59.3  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_003296  RS01891  transcription regulator protein  30.81 
 
 		 219 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0139537  normal  0.638618 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4096  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.428343  normal  0.46248 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  26.69 
 
 		 214 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  26 
 
 		 192 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4573  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4661  TetR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.227652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 191 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 		 214 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14700  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.73009e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0282  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.356366  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 192 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9268  putative transcriptional regulator, TetR family  28.8 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.596158 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3849  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.782429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3873  regulatory protein TetR  26.44 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1924  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.147097  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3553  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500909  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3626  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.757995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3558  TetR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.267611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 198 aa  55.1  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6801  transcriptional regulator, TetR family  31.46 
 
 		 217 aa  55.5  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.142519  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  25.33 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  38.96 
 
 		 400 aa  55.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 196 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2766  regulatory protein, TetR  39.74 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.597397  hitchhiker  0.0084658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  51.02 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2914  transcriptional regulator, TetR family  28.75 
 
 		 202 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 189 aa  54.7  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3977  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698976  normal  0.0354344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0356  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 235 aa  54.3  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00145185  hitchhiker  0.0000223354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3963  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4037  TetR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1050  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 193 aa  53.9  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5152  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 194 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.8 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  26.9 
 
 		 194 aa  53.5  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 189 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47240  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4348  TetR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 174 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 248 aa  53.1  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 223 aa  53.5  0.000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2228  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 332 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11281  transcriptional regulator  26.5 
 
 		 202 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.786647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1523  TetR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120489 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3011  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 214 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  27.75 
 
 		 198 aa  52.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3779  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 		 194 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0364  TetR family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 220 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  27.18 
 
 		 204 aa  52.8  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3641  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0507549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0778  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.308556  normal  0.547023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1833  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.226385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0144  transcriptional regulator, TetR family  31.54 
 
 		 192 aa  52.8  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 193 aa  52.4  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2194  regulatory protein, TetR  28.19 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2434  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 211 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1799  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.539023  normal  0.822653 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  28.86 
 
 		 199 aa  52.4  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 219 aa  52.4  0.000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05640  transcriptional regulator  32.41 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.950785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  38.16 
 
 		 242 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 242 aa  52  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4076  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 204 aa  52  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.462339  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>